韓國施行總統制，在總統競選政策承諾訴求下，中央集權程度相當高，科技管理亦採取集中協調機制，使得韓國的科技發展能由政府統籌規劃執行。政府先確定國家長期發展目標，規劃前瞻技術發展，選擇所需要的技術領域，並推動相關措施。

在科技政策決策體制與預算分配上，亦採中央集權模式，透過總體協調方式，如盧武鉉總統執政期間(Roh Moo-hyun, 2003至2007年)由副總理兼任科技部長並在該部設置科技創新辦公室(the Office for Science and Technology Innovation, OSTI)，主導整體協調國家科技政策，促進跨部會科技政策協調及研發預算分配。

2008年李明博總統就任後(Lee Myung-bak, 2008至2012年)，即廢除科技創新辦公室，強化部會職權，委派策略財務部(the Ministry of Strategy and Finance , MOSF)聽取國家科學技術委員會(the National Science and Technology Council, NSTC)意見做為預算分配之參酌基礎。

李明博總統就任後，即進行大幅度的組織改造，重新架構韓國科技生態系統，以綠色為政策主軸帶動國家創新。將已成立多年的科學技術部與教育部結合，合併為教育科學技術部(MEST)，並因應今後全球發展趨勢整併相關部門成知識經濟部(MKE)。藉以確立教育科學技術部主導基礎科學，知識經濟部主管國家知識經濟與產業技術發展，並重整公共研究機構，期以科技實力創新國家經濟發展。

2011年3月底，國家科學技術委員會(NSTC)修改相關法規，提供法定框架，將策略財務部(MOSF)及國家科學技術委員會(NSTC)原有的研發評估與預算分配角色進行轉換，重建成以研發評估為基礎來決定研發優先順序，由高層掌控的政府研發預算之協調分配。

韓國政府最高管理階層為直屬總統之各單位，如綠色成長總統委員會(PCGG)等。但主要是由國家科學技術委員會擔任政府研發領域優先順序及預算分配等重要工作，國家科學技術委員會約掌握約四分之三研發預算的分配權，亦進行研發計畫評估，並管理政府資助研究機構。策略財務部依據國家科學技術委員會的決策進行預算分配，教育科學技術部負責管理基礎研究所需，知識經濟部負責管理產業技術發展所需。

政府政策研析、計畫管理、技術前瞻與規劃、評估和協調的支援，則交由韓國科學技術企劃評價院(The Korea Institute of Science and Technology Evaluation and Planning, KISTEP)，以公共專業機構模式協助國家科學技術委員會；隸屬於國務總理辦公室的科學技術政策研究院(The Science and Technology Policy Institute, STEPI)則以政策研究為基礎，提供科技諮詢服務。

2013年韓國朴謹惠總統上台執政後，再次進行政府組織改造，強調治理未來設立未來創造科學部，並廢除國家科學委員會。在此政府體制中，同時成立資通訊策略委員會由總理擔任主席，並由未來科學部長擔任幹事，負責統合協調政府的ICT政策，另由經濟副總理兼任企劃財政部長，以推動創意經濟並厚植中堅企業，以改善產業競爭力結構。

未來創造科學部為加強韓國政府預算補助研究機構支援與培育的功能，擴大韓國政府預算補助研究機構間的合作，以及提高研究會的運作效率。2014年6月，政府將韓國基礎技術研究會與韓國應用技術研究會合併為韓國國家科學技術研究會(NST)。因此，韓國科學技術研究院系隸屬韓國國家科學技術研究會下之韓國政府預算補助研究機構。

2015年韓國未來創造科學部再次進行組織變革，目的在於ICT研發技術與現有產業之融合、研發創新、促進未來成長動力等。為了有效率的實施未來創造科學部的主要核心議題而整頓、彌補其機能，組織改造之重點如下：

(一) 強化基礎研究、大型研究計畫的支援系統。

(二) 建立研發成果商品化及創業支援系統

(三) 強化國家研究開發政策創新支援系統。

(四) 建立融合ICT與其他產業的支援系統。

(五) 為了強化網路資訊安全而新設專責的組織。

(六) 建立以成果導向且效率的組織文化，推動創新方案「SMART3.3.3」。

2017年7月韓國未來創造科學部再次進行組織變革，依據《政府組織法》修訂案在韓國國會通過，以調整部會的機能與加強部會人力，並將名稱變更為「科學技術情報通信部(Ministry of Science and ICT, MSIT)」。此外，並向下成立主管科技政策的「科學革新本部」，主要在制訂與調整科學技術政策，以及進行研發戰略性的投資。藉由強化司令塔的角色定位與機制，提高科學技術的競爭力，以因應快速變化的科學環境。